Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms