Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttll9A2APC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms