Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabreA2AMW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GabreA2AMW3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms