Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930447F04RikA2AFR2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms