Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnksr1A2A9K7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnksr1A2A9K7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms