Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm2A2A7B5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms