Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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