Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv23A0A0A6YWQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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