Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms