Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RpainQ9CWY9 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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