Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Smurf1Q9CUN6 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms