Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Trim35Q8C006 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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