Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snx17Q8BVL3 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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