Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms