Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms