Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Trim58Q5NCC9 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Trim58Q5NCC9 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Trim58Q5NCC9 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Trim58Q5NCC9 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim58Q5NCC9 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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