Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd13P70217 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd13P70217 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms