Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms