Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RxraP28700 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RxraP28700 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms