Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Ccl20O89093 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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