Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc6D3YZP9 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms