Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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