Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Sh3bp2Q06649 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sh3bp2Q06649 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms