Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms