Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TtrP07309 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms