Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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