Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp9yF8VPU6 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms