Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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