Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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