Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim35Q8C006 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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