Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RxraP28700 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RxraP28700 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RxraP28700 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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