Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd10P28359 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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