Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Hoxd9P28357 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd9P28357 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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