Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PrkcaP20444 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms