Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TtrP07309 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TtrP07309 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms