Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Ccl20O89093 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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Ccl20O89093 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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Ccl20O89093 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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