Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Usp9yF8VPU6 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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