Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Spocd1B1ASB6 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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