Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms