Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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