Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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