Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxa13Q62424 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms