Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Trim58Q5NCC9 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim58Q5NCC9 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Trim58Q5NCC9 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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