Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Shank3Q4ACU6 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Shank3Q4ACU6 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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