Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Shroom4Q1W617 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Shroom4Q1W617 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms