Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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ptchd1Q14B62 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ptchd1Q14B62 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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