Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpusd2Q149F1 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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