Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VgfQ0VGU4 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VgfQ0VGU4 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms