Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms