Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms